Instance originale présidée par la conseillère régionale référente et par le vice-président du pays de Saint-Brieuc en charge de la contractualisation et des fonds européens, le comité unique de programmation est chargé de mettre en œuvre la stratégie du Pays par l'examen des projets sollicitant les crédits régionaux du contrat de partenariat, et est force de proposition pour l’animation du dispositif.
Il assure la coordination entre les différents fonds territorialisés du contrat– régionaux ou européens, et s’assure de la cohérence des projets avec les problématiques et les priorités définies au sein du contrat.